یوحنی یار محبوب عیسی مسیح بود و عیسی بر روی صلیب به مریم مادرش و یوحنا " ای مادر یوحنی اینک پسرت و ای یوحنی مریم اینک مادرت
بهنظر میرسد که برای چند سالی اورشلیم محل سکونت اصلی او بوده باشد. بر اساس روایت معتبری، او سالهای آخر عمر خود را در افسس گذرانید. در مورد فعالیتها و خدمات او در افسس، اطلاع چندانی در دست نیست. وی دوران کهنسالی طولانی خود را در افسس گذرانید و در آنجا انجیل، سه رساله و کتاب مکاشفهٔ خود را بهرشتهٔ تحریر درآورده است
اپیفانوس تاریخ وفات وی را در سال سوم سلطنت تروجان یعنی سال ۱۰۰ میلادی میداند و اظهار میدارد که او در سن ۹۴ سالگی در افسس از دنیا رفتهاست.
یوحنا در دوران شکنجه مسیحیان در رُم در یک دیگ پر از روغن در حال جوش انداخته شد، اما بطور معجزه آسایی از مرگ نجات یافت. یوحنا بعدا به زندان با اعمال شاقه در معدن و در جزیره ای بنام پاتموس تبعید شد. او کتاب مکاشفه را در آنجا نوشت. یوحنای رسول بعدها آزاد شد و به ترکیه امروزی برگشت. او در پیری جان سپرد